Structura de Securitate este structura de specialitate care coordonează, îndrumă şi controlează întreaga activitate în domeniul protecţiei informaţiilor clasificate ce se desfăşoară la nivelul inspectoratului.
Atribuţiile generale ale Structurii de Securitate rezultă din prevederile H.G. nr. 585/ 2002 pentru aprobarea Standardelor naţionale de protecţie a informaţiilor clasificate în România, respectiv elaborează şi supune aprobării conducerii unităţii normele interne privind protecţia informaţiilor clasificate, potrivit legii, coordonează activitatea de protecţie a informaţiilor clasificate, în toate componentele acesteia.
Structura de Securitate asigură relaţionarea cu instituţia abilitată să coordoneze activitatea şi să controleze măsurile privitoare la protecţia informaţiilor clasificate, potrivit legii, monitorizează activitatea de aplicare a normelor de protecţie a informaţiilor clasificate şi modul de respectare a acestora, consiliază conducerea unităţii în legătură cu toate aspectele privind securitatea informaţiilor clasificate, actualizează permanent evidenţa certificatelor de securitate şi a autorizaţiilor de acces.